Nein, ist egal. Story mäßig haben die nur am Rande was miteinander zu tun und es gibt in Automata einige Anspielungen die man nur versteht wenn man der Vorgänger kennt, aber es ist keinesfalls notwendig diesen zuerst zu spielen.
Ich denke ich würde erstmal mit Automata anfangen, und wenn du es geil findest, dann den ersten angehen.